حضرت آیة الله بشیر نجفی در دیدار هیئت اعزامی کنگره بزرگداشت ملا عبدالله بهابادی یزدی ، رمز موفقیت این دانشمند بزرگ را تزکیه نفس دانسته و تأکید کردند: تزکیه نفس و اخلاص در انسان ، توسط عوامل متعدد شکل می گیرد که به نوع تفکر و رفتار فرد باز می گردد و توجه ویژه به مسأله تهذیت و تزکیه نفس، یکی از ویژگی های بارز ملا عبدالله است . این خصیصه را میتوان از مطالعه کلمات و آثار ایشان احساس و ادراک کرد و این مهم ، یکی از عوامل اساسی است که در پیش برد اهداف مادی و معنوی اثر گذار است .
این مرجع تقلید ، دانستند و گفتند: سییره معنوی در تربیت نسل های آینده اثر گذار است و روش علامه در نگارش و ارایه مطالب، برای طلاب مفید خواهد بود.
حضرت آیة الله بشیر نجفی افزودند: نباید طلاب را به بهانه سنگین بودن یک متن درسی مانند حاشیه ملا عبدالله ، از خواندن آن محروم کرد و قطع ارتباط نسل جدید با نسل قدیم را سبب شد .
کتاب های روان و ساده، تهدیدی برای حوزه هاست. طلاب باید با روش صحیح منابع اصیل حدیثی، رجالی و قرآنی آشنا شده و پس از فهم درست و روشمند، آن را با زبان و منطق گویا بیان کنند.
ایشان در پایان توصیه کردند، دبیرخانه کنگره درباره دیگر آثار ملا عبدالله نیز تحقیق کند.